11.Update-Database実行時に「ファイルまたはアセンブリ ‘System.Data.SQLite.EF6, Version=1.0.104.0, Culture=neutral,~~~」エラーが発生する

パッケージマネージャーコンソールで「Update-Database」や「Add-Migration InitialMigration」を実行した時に

ファイルまたはアセンブリ ‘System.Data.SQLite.EF6, Version=1.0.104.0, Culture=neutral, PublicKeyToken=db937bc2d44ff139’、またはその依存関係の 1 つが読み込めませんでした。見つかったアセンブリのマニフェスト定義はアセンブリ参照に一致しません。 (HRESULT からの例外:0x80131040)

のようなメッセージが出る場合は、ソリューションの「スタートアッププロジェクト」とパッケージマネージャーコンソールの「既定のプロジェクト」が同じものを選択しているか確認します。違っている場合は、このようなエラーが発生します。